Thomas Walpuski は、OpenBSD の isakpmd を Linux 2.5 IPSEC で動作するようにしたパッチを書いたと報告してくれました。 さらに、現在は isakpmd のメインの CVS リポジトリにこのコードが入っています。 彼のページ にも記述があります。
isakpmd は前述の racoon とはかなり違いますが、こちらを好む人もたくさんいます。 こちら から入手できます。より詳しくは、 OpenBSD CVS を見てください。 Thomas は CVS やパッチが面倒な人向けに tarball も用意してくれています。
さらに、FreeS/WAN のユーザ空間のツールを Linux 2.5 のネイティブな IPSEC で使えるようにするパッチもあります。こちら にあります。