BIND 9 の配布アーカイブや、パッケージ化されたバージョンには、
migration という文書が含まれており、
そこに BIND 8 から BIND 9 に移行するための情報が記述されています。
この文書は非常にわかりやすく書かれています。
バイナリパッケージをインストールした場合は、
/usr/share/doc/bind* や /usr/doc/bind*
あたりに置かれていると思います。
BIND 4 を使っている人は、同じ場所にある
migration-4to9 を見てください。