リブート中に、シリアルコントローラーはリセットされますから、 モデムの制御ライン "Data Terminal Ready" は落ちます。 すると今度はこれが原因になって、モデムがハングアップしてしまいます。
だからといって誘惑に駆られて、 DTR を無視するようなモデムの設定にはしないでください。 そうしてしまうと、このバグはもっと始末が悪くなってしまいます。 こうなると、電話は正しく切れなくなるし、モデムは動いたままになり、 クリアする方法はなくなります。 DTR を無視すると、 悪意のある人が電話をかけてきても、クリアする方法も無くなります。
コンピュータが Restarting system というメッセージを出してから、 ブートローダーのプロンプトを出すまでに要する、 総時間を記録したいこともあるでしょう。
でも モデムはブートしている間に （シリアルチップがリセットされるので）ハングアップしますし、 あるいは init のランレベルが変わる時も （getty が再起動するので）、 ハングアップします。