私の HP Omnibook 800 の仕様書には、使っていないときには赤外線ポートをオフにしてくださいと記載されています。 バッテリ動作時間が 10% 程度短くなってしまうからです。
必要な場合、カーネルの IrDA セクションで高速 RR 機能を無効にすることも試してください。 このオプションは転送遅れを大幅に軽減しますが、電力消費は増えます。