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2. 医学・医療用アプリケーション

2.1 Freemed

freemed はウェブブラウザウインドウで動く 医療業務管理ソフトウェアパッケージです。これは現在 Apache、SQL バックエンド(MySQL を使うのが普通ですが、 SQL Abstraction もあります)、PHP で作られていてブラウザに依存しません。freemed は あの Medical Manager のようなプログラムの機能をそっくり再現して、しかもコミュニティにたいしてフリーであることを 目指しています。

2.2 Freemed-YiRC

Freemed-YiRC は Freemed をベースとした PHP パッケージで青少年入所施設ケア (Youth in Residential Care - YiRC)機関で使用されます。これの目的はカスタマイズできない 旧来のノンフリーなアプリケーションを完全な形で置き換えることです。PHP ベースですのでクライアントに必要な ものは拡張テーブルをサポートしている高品質のウェブブラウザだけです。

2.3 Good Electronic Health Record - GEHR

openEHR Foundation の主要な成果の 1 つの Good Electronic Health Record (GEHR) は 現在進行形の電子カルテの アーキテクチャで、包括的で移植性が高く法的に耐え得る構造に設計されています。 これは電子カルテに関してこれまでで最も包括的な要求事項文書である Good European Health Record project の要求事項とオブジェクトモデルに 従って開発されています。このウェブサイトはこの電子カルテの具体化に使用した資料とリソースの公的資源 (public resource)です。

2.4 Conversion of ECGs - ecg2png (ECGs の変換 - ecg2png)

ecg2png はスキャナーで取り込んだ 12 誘導心電図(ECGs)を PNG フォーマットに変換するとともに ウェブフレンドリな画像サイズにします。このプログラムは次に述べるような問題を解決します。すなわち比較的高解像度で スキャンされた ECG は六百万ものカラーピクセルを持っていてウェブブラウザに大きいメモリ負荷をかけ、また一般的な スキャナーは白紙の ECG を単に赤、黒、白だけでなく多くのカラーに変換します。その結果出来たファイルは効率よく 圧縮出来なくて低速度のネットワーク接続を通じてでは伝送に多くの時間がかかります。このプログラムは信号を保持しながら 画像を圧縮しカラーマップを一掃してウェブ上での配布に適したビットマップの ECG 画像にします。

2.5 GTDS - Oncologie Documentation (German) (GTDS - 腫瘍学ドキュメンテーション、 ドイツ語)

Giessener Tumor Documentation System - GTDS は実際は SCO-Unix 上で Oracle データベースシステム用として作られていますが iBCS モジュール が使われている Linux 上でも動きます。

2.6 Linux in a Doctor's Office (German)

Karsten Hilbert <mailto:Karsten.Hilbert@gmx.net> は Linux in a doctor's office のセットアップ法を順に記述したウェブページをドイツ語で立ち上げています。 これは PraxisComputer 6/99 の記事に基づいています。

2.7 Andromeda (German)

Andromeda はドイツ語で書かれている オープンソースの診療所情報管理システムです。

2.8 Res Medicinae (German)

これはたぶん多くの国々でも同じだと思いますがドイツにおいて確実なことは、医師の診療に使われている 事務処理用ソフトウェアの約 80% はいまだにアンティークな DOS です。 当世風のグラフィカル ユーザー インタフェース(GUI)が徐々にマーケットシェアを獲得していますが、 その大半はバグの多い、にもかかわらず高価な MS WINDOWS に基づくものです。

システムを購入するとユーザー(医師)はプロバイダとコストの掛かるアップデートに拘束されます。これらはパブリック へルスシステムと技術進歩の絶え間ない変化に対応するため必要です。

Res Medicinae が 試みているのは医療情報システムの領域における高価格体系の克服、および最新のテクノロジの使用と他の多くの医療用 システムにたいしてオープンであることにより、ユーザーに安定した、プラットフォームに依存しない、拡張性のあるシステム を提供することです。

2.9 Linux Port of Mallinckrodt CTN Software (Mallinckrodt CTN ソフトウェアの Linux への移植)

Nijmegen 大学病院 放射線画像診断部門 (Nijmegen MRI Research Group - NMRG)の Mark Stoutjesdijk <m.stoutjesdijk@rdiag.azn.nl> によって移植されました。

2.10 Endoscopy (内視鏡検査)

Linux に対する直接のネイティブサポートのある GI-Trac (TM) 2000 version 4.5 が ASD/MediTrac から発表 されました。 GI-Trac はデータベースでありまた内視鏡検査報告システムです。 ライセンス - 商用

2.11 LinuDent

LinuDent はコンソールモードまたは X 上で動く歯科診療用経営管理ソフトウェアパッケージ です。X 用バージョンは GTK を使用していて Linux のもとで開発が進められています。このパッケージの目的は 総合歯科管理プログラムの機能すべてを再現し、しかもコミュニティにたいしてフリーであることを目指しています。

2.12 VISIdent (German)

商用ソフトウェアの VISIDent は BDV が 作成した ドイツの歯科医師向け GUI ベースの情報検索と経理システムです。

2.13 Quality Documentation Statistic - QDS (German)

QDS は オープンソースのパブリック へルスケア向け医療用カタログとドキュメンテーション システムです。

2.14 GNUMed

GNUMed はペーパーレス医療向けの包括的であるとともに確固たるオープンソース ソフトウェア パッケージです。GNUMed は完全にオープンソースです。開発に使用されているツールのどの一つをとってもそれはオープンソースで、商用の ソフトウェアは全く使われていません。

GNUMed サーバーは GNU/Linux や freeBSD のような Unix タイプのオープンソース ソフトウェア上で 動作します。WinNT (これはお奨めしません)のような商用のソフトウェア上でも同じように動作します。 GNUMed クライアントは TCP/IP をネットワーク コミュニケーション に使うことができるプラットフォーム にも本物のシン クライアントにも何にでもなることができます。

GNUMed の主なクライアント(アドミニストレーション クライアント) は GTK+ / VDK ツールキットで 作成されたグラフィカルユーザインターフェースを簡単に使用出来ます。他のクライアントは正確に定義された API で データベースサーバで扱われる多くのプログラム論理を簡単に記述することができます。GNUMed は 頑強な SQL クライアントサーバ コンセプトに基づいておりデータベースの完全性を常にモニタする機構が備わっています。 もし何らかの理由でデータが損なわれたならすぐに通知されます。2 層のトランザクションプロトコルにより どんな障害からでもいつでも回復することができます。

GNUMed の特徴は内蔵しているトランザクションロギングとデータの暗号化でそれはデータの安全性を高くしセンシティブ なデータの機密性を最大限に保証します。

2.15 The Littlefish Health Project

Littlefish プロジェクトは地域の保健機関のためのオープンソースでユーザーフレンドリな 患者情報検索システムです。このプロジェクトは GEHR つまり Good Electronic Health Record の 基準に従います。

2.16 Free Practice Management - FreePM

FreePm は医療従事者が設計した (provider designed) 患者中心の電子カルテと診療管理アプリケーションを構築するオープンソース プロジェクト です。

2.17 PhysioNet

PhysioNet によりウェブを 経由して多量の生体信号記録のコレクションおよび関連のオープンソース ソフトウェアに自由にアクセスできます。 PhysioNet は Research Resource for Complex Physiologic Signals の 行う公共のサービスであり National Center for Research Resources of the National Institutes of Health の資金提供を受けています。

PhysioNet が属している Research Resource for Complex Physiologic Signals は 共同プロジェクトであり、ボストンの Beth Israel Deaconess Medical Center/Harvard Medical School、Boston University、McGill University、および MIT の研究者が 始めました。これは National Center for Research Resources of the National Institutes of Health が後援しています。この研究リソースは複合した生体および生理信号の 現行および新規の研究の振興を目的としており、密接に関係する三つの構成要素から成り立っています。

上記では言及しなかった二三の興味深い項目 -
  1. 我々のソフトウェア開発の全ては Linux のもとで行われています。提供されたソフトウェアは Linux 用に 書かれていないものであっても Linux に移植されます。ほとんどのソフトウェアは UNIX の他のバージョン に移植可能であると同様に他のオペレーティングシステムにも移植できます。
  2. 生体信号処理、分析、および視覚化アプリケーションの大部分は W3C-libwww に蓄積されている共通のライブラリで 構築しています。これらアプリケーションはローカルまたはウェブサーバー上のデータに対してアクセス透過性を与えます。 (言い換えればこれらは独立した HTTP クライアントとして動作することができます)これらは共同研究を支援するように 設計されていますが多くは遠隔医療業務に有効でしょう。このライブラリを使用して全く簡単に新しいアプリケーションを作成 できます。そしてそこにはアプリケーションの開発を始める人を援助するための豊富なオンラインチュートリアルおよび リファレンス資料があります。
  3. データコレクションのなかには相当数の標準的な、注釈つき心電図データベースがあります。(なかには1970年代半ばに我々 が作成を始めた幾つかのデータベースおよび作成者により寄贈されたデータベースが含まれています) これらの心電図 データベースは現行の ANSI あるいは検討中の ISO 基準に関連して US FDA などの監督官庁による 心電図計の自動解析機の検査に不可欠です。これらのデータは NIH/NCRR の援助によって最初にウェブ上での 自由な利用が可能になっています。
  4. 約 12 GB のデータが現在オンライン上にあります。そして目下、別の 60 GB が待機していて我々がサーバーに ディスクを増設したときに数ヵ月をかけて追加される予定です。

2.18 REALTIQ - ReAligning Tissue Quantifier

REALTIQ は Re-aligning Tissue Quantification の略です。この ソフトウェアはいまのところアルファ版です。

ソフトウェアの特徴 -

説明 -

このソフトウェアの試作版は関節炎に罹った患者の骨髄腔寸法(medullary-canal dimensions) と皮質骨領域(cortical-bone area)との関連を研究するために開発されました。

CAT データについてはもし対象(このばあいは手/指)が CAT の軸線に正確に沿っていない場合、断面は骨のねじれた 画像を表示し定量測定は高いエラー率になってしまうという問題があります。

REALTIQ は DICOM 画像のセットを読み込んでそれを観察者に frontal、sagittal、 transversal 画像として表示します。ユーザーはこのデータによりマウスを使って直観的に軸線と その周りの境界ボックスを指定することができます。データセットは新しい軸線に対してマップされ対象の 構造が適正にそろえられます。次いでソフトウェアが以下の計算を行います -

詳しくは DigitalMedics をご覧ください。

2.19 Open Infrastructure for Outcomes (臨床経過オープンインフラストラクチャ)

OIO はウェブベースの治療経過管理 の情報システムです。Harbor/UCLA 診療管理/リサーチデータ医療センターがこれを作成しました。OIO が 作成しどの OIO サーバでもホストされるフォームが XML ファイルでダウンロードできます。"フォーム ライブラリ" からダウンロードして OIO サーバにインポートしてしまうと必要なデータベーステーブルが自動的に再作成されて そのインポートされたフォームを OIO サーバのユーザーは直ちに使用できるようになります。

2.20 CTSim

CTSim は GPL ライセンス下の コンピュータトモグラフィシミュレータです。CTSim はファントムの X 線データを取得するプロセスを シミュレートします。それから元の画像を再構築するため多様な再構築アルゴリズムを使用します。読取りと再構築 の過程はコンピュータトモグラフィのチュートリアルとしてアニメ化することができます。プリコンパイル版が Microsoft Windows および Linux に使用できます。

2.21 myPACS

MyPACS はウェブベースの医療画像管理システムです。MyPACS は PHP 3.x で書かれて おり、リレーショナルデータベースのバックエンドに MySQL を使用しています。これの機能は検索すること、画像および 患者データをウェブブラウザから、共有あるいは専用の画像リポジトリへアップロードすることと ImageMagick を 使用したサムネイル作成および画像変換です。MyPACS は今のところ DICOM 基準との互換性はありません。

2.22 LIMS - Laboratory Information Management Systems (LIMS - 検査室情報管理システム)

LIMS ASTM Standard(E1578 検査情報管理システム標準ガイド)は Annual Book of ASTM Standards Volume 14.01 Healthcare Informatics - Computerized Systems and Chemical and Material Information にあります。この基準には小さい 専門用語の節があって LIMS に関連した 25 個の用語が掲載されています。この標準ガイドは初めての LIMS ユーザー に対する LIMS の目的および機能とそれの取得方法の教育が目的です。

この書籍には LIMS に関連したもう1つの補足的な標準が載っています。E2066 Standard Guide for Validation of Laboratory Information Management Systems(E2066 検査情報管理 システムの妥当性に関する標準ガイド)です。

Blaze Systems Corporation LIMS による BlazeLIMS サーバは Linux 上で サポートされています。

2.23 Meditux

Meditux は Java-servletベースのソフトウェアであって MySQL への、すなわち潜在的に JDBC が使える データベースエンジンへの、ウェブインタフェースを提供しています。これは臨床および研究データを収集する 集中治療室のイントラネットサイトをサポートするために開発されました。

2.24 XBNC

XNBC は生体系 神経回路網シミュレーションソフトウェアパッケージです。4 つのニューロンモデルが使用可能であり、内 3 つは 現象学的モデル(xnbc、リーキーインテグレータ、コンディショナルバースタ)、もう 1 つはイオン伝導ベース モデルです。シミュレートされたニューロンモデルへはファイルに蓄積した実験データを入力することができるとともに ハイブリッドな回路網も作成できます。グラフィックツールは回路網だけでなくニューロンモデルも記述 できます。

2.25 HL7lib - Health Level 7 Library

HL7lib Health Level 7 Library はフリーで適切な Health Level 7 機能の実装です。 Health Level 7 は 大規模な病院においてベンダーが異なるコンピュータシステム間で患者情報を送信するのに一般的に使われています。 HL7 には参考となる実装がないのでこれらベンダーのシステムの多くは HL7 の解釈が大きく異なっています。

2.26 OMEGA and Mumps Compiler (OMEGA および Mumps コンパイラ)

Mumps コンパイラは主として医療(healthcare)用に使用される Mumps 言語のサブセット用コンパイラです。 標準 C コンパイラを備えたほとんどの OS と互換性があります。ライセンス - GPL

OMEGA は M テクノロジ (MUMPS)プログラミング言語の実装であってオープンソースです。これは拡張可能であって目下 MySQLが組み 込まれています。OMEGA は SQL のトリガ/バリデーション(trigger/validation)フロントエンド として理想的です。ライセンス - 非商用ならフリー


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