BioMail は 医学研究者および生物学者のための小規模ウェブベースアプリケーションです。これは PubMed Medline データ ベースにおける最近の科学論文の自動検索用に書かれています。BioMail はユーザーがカスタマイズした形の検索を 定期的に Medline に対して行い、新しく Medline に加えられた論文の中でマッチングしたすべての論文を ユーザーの e メールアドレスへ送ります。
DubMed は java ベースの Medline (Pubmed) インタフェースです。これのサーバサイド バックエンドが国立医学図書館の Entrez システムから検索結果を受け取ります。DubMed にはビジュアルな検索方式のパレットがあり、見つけた引用から オンライン定期刊行物にリンクするために定期刊行物メタデータリポジトリを使用可能なときは使用します。
Pybliographer は 書誌データベース管理ツールです。これはいくつかの書誌フォーマットをサポートしており GNOME 用の快適な グラフィカルインタフェースを介して検索、編集、再フォーマットその他が使用できます。Pybliographer は その本質から多数の用途(書誌検索者別 HTML を作成するなど)に拡張できます。これにはスクリプト例が付いています。 国際化、Medlineサポート、LyXサポート、スピードアップ諸々です。
sixpack は Perl/Tk で書かれたグラフィックおよびコマンドラインの書誌データベースマネージャです。これは提供された bp を使って対話します。bp は bibtex，endnote，medline，procite そのほかを 含む多数のフォーマットからインポート／エクスポートができます。リファレンスを直接 Web からダウンロードしたり 外部のビューアで論文を開くことも可能です。
Surfraw (Shell Users' Revolutionary Front Rage Against the Web) は 人気がある多様なウェブ検索エンジンとサイトに UNIX コマンド・ライン・インタフェースを提供します。 これらサイトには，Google、Altavista、Raging、DejaNews、Research Index、Yahoo!、 WeatherNews、Slashdot、freshmeatその他多数があります。Freshmeat、 NewScientist、 MedLine、および PubMed databases (PubMed, Nucleotide, Protien, Genome, Structure, Popset)の新しい elvi クライアントと、もっと多くの Google サーチタイプ (BSD, Linux, Mac, UncleSam)へのサポートもあります。